华南农业大学农学院

作物科学与基因组学创新中心

资源中心

本中心所有硬件设施由国内专业服务服务器团队——浪潮信息股份有限公司搭建而成,配备65台高性能服务器,合计3256核心与37512GB内存,1.3PB存储空间,搭配专业堡垒机保证集群安全。此外集群配有数十种专业生物信息学分析软件,供用户使用。 建有玉米泛基因组数据平台,Oryza AA lncRNA数据库平台,以及建设中的甘薯数据库平台和烟草数据库平台,为科研人员提供全方位的技术支持和资源共享服务,促进科研成果转化和应用。

平台总览

玉米泛基因组数据平台

提供自有100份高质量玉米全基因组序列、变异信息和功能注释数据,提供单倍型分析平台

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Oryza AA lncRNA数据库平台

水稻长链非编码RNA数据库,提供功能预测和表达分析,提供blast序列比对平台

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甘薯数据库平台

平台收集了甘薯的基因组、转录组、蛋白质组等多组学数据,为甘薯遗传改良和品种培育提供数据支持。

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烟草数据库平台

平台整合了烟草的基因组和功能组学数据,为烟草研究和应用提供数据资源和分析工具。

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计算资源

中心拥有高性能计算集群,为科研人员提供强大的计算支持。计算集群包括:

    CPU节点62台,总核心数3256

    FAT胖节点2台

    GPU计算节点1台

    存储空间总容量超1PB

计算资源主要用于基因组组装、变异检测、转录组分析、蛋白质结构预测等计算密集型任务。

生物信息学工具

平台安装有生物信息学分析工具,包括:

这些工具为科研人员提供了便捷的数据分析手段,加速科研进展。

资源使用申请

校内师生可通过以下方式申请使用中心资源:

    1. 填写《HPC用户使用协议书》点击下载

    2. 经负责人签字或盖章后扫描为电子版,发送至邮箱zengzh@scau.edu.cn

    3. 经中心审核通过后,按新用户操作指南使用SSH连接至HPC即可使用

如有任何疑问,请联系中心办公室(农学院506)或发送邮件至gbc@scau.edu.cn,亦可加入微信群咨询。

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