资源中心
本中心所有硬件设施由国内专业服务服务器团队——浪潮信息股份有限公司搭建而成,配备65台高性能服务器,合计3256核心与37512GB内存,1.3PB存储空间,搭配专业堡垒机保证集群安全。此外集群配有数十种专业生物信息学分析软件,供用户使用。 建有玉米泛基因组数据平台,Oryza AA lncRNA数据库平台,以及建设中的甘薯数据库平台和烟草数据库平台,为科研人员提供全方位的技术支持和资源共享服务,促进科研成果转化和应用。
平台总览
计算资源
中心拥有高性能计算集群,为科研人员提供强大的计算支持。计算集群包括:
CPU节点62台,总核心数3256
FAT胖节点2台
GPU计算节点1台
存储空间总容量超1PB
计算资源主要用于基因组组装、变异检测、转录组分析、蛋白质结构预测等计算密集型任务。
生物信息学工具
平台安装有生物信息学分析工具,包括:
基因组组装和注释工具:jellyfish、fastp、bwa、hisat2、Augustus
变异检测和分析工具:bcftools、STAR、gatk、syri
转录组分析工具:stringtie、R-base
功能基因组学分析工具Interproscan、gromacs
进化分析工具:iqtree、mcScan
这些工具为科研人员提供了便捷的数据分析手段,加速科研进展。
资源使用申请
校内师生可通过以下方式申请使用中心资源:
1. 填写《HPC用户使用协议书》点击下载
2. 经负责人签字或盖章后扫描为电子版,发送至邮箱zengzh@scau.edu.cn
3. 经中心审核通过后,按新用户操作指南使用SSH连接至HPC即可使用
如有任何疑问,请联系中心办公室(农学院506)或发送邮件至gbc@scau.edu.cn,亦可加入微信群咨询。