基因组学与生物信息学创新研究中心(Center of Genomics and Bioinformatics)(以下简称“基因组创新中心”),依托华南农业大学农学院与园艺学院成立,农学院院长储成才教授为中心主任。多个领域专家教授学者入驻基因组创新中心,组建多支中心技术团队,搭建一个多学科交叉性质的计算平台。为生命科学相关各学科科研提供高质量的生物信息服务,旨在为我校高水平科学研究提供高质量的生物信息服务,逐步催生重大研究成果,助力“双一流”建设。
机房及集群介绍 高性能计算集群服务器存放于农学院一楼,连接学校网络,保障了数据的安全。 目前,高性能计算服务器共包含CPU 节点 62 台,FAT胖节点2台,GPU 计算节点1台,总核心数为3256,存储空间总容量超1PB。目前集群设置3个分区,不同分区适用于内存需求较高的纯CPU计算应用程序和CPU+GPU异构计算的应用程序 为了方便平台用户进行基本生物信息学数据分析,该平台安装了Python、Perl、R等主流编程语言与分析软件。定期更新下载多个开源的生物信息学相关数据库资源,例如水稻重测序/转录组数据、荔枝转录组数据、玉米重测序/转录组数据等。
同时,机房配置了全局环境监控模块,可实时监控集群运行状态、机器资源、作业状态及网卡使用情况,提供丰富的监控指标、准确实时的数据更新能力,从而实现更加高效的执行计算、合理分配和利用集群资源。
服务介绍
基因组创新中心主要提供以下服务: (1)计算服务 高性能计算和存储资源
提供相关组学数据存储空间和计算资源,对接各大网络信息平台和数据库,为数据的整合、分析、挖掘提供便利。
(2)技术服务
生物信息分析方法、流程和工具
提供基础的标准分析流程及下游数据分析和可视化工具,满足不同科研人员对生信分析的个性化需求。
(3)咨询服务
生信分析咨询,生信人员指导
配备专业高效的技术服务小组,协助全校师生解决在科研中所遇到的生信相关的问题。
(4)培训服务
生信技能培训及交流学习平台
不定期安排生物信息相关的基础培训和专题培训,提升师生的生信分析能力以及在科学研究中灵活应用的能力。
集群免费开放 目前中心集群主要用于支持教学科研,已完成组内测试,并于6月17日正式进入全校测试阶段,配备了良好的软硬件环境,测试期间为全校师生提供免费的服务,支持我校科研工作和成果转化。
扫描下方二维码获取使用申请表,发送至邮箱zengzh@scau.edu.cn,名额有限,先到先得,赶紧报名吧。
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